As entidades sob a jurisdição do Tribunal de Contas da União (TCU) se submetem a dois tipos principais de auditoria, que são as Auditorias Operacionais e as Auditorias de Regularidade. Estas últimas, que examinam a legitimidade e a legalidade dos atos de gestão no que se refere aos aspectos orçamentário, financeiro, contábil e patrimonial, compõem, segundo normas do próprio TCU, outros dois tipos de auditoria, que são: