Os Laboratórios de Inovação buscam identificar práticas que possam trazer benefícios concretos e mensuráveis para profissionais, grupos ou organizações, utilizando metodologias como estudos de caso, ciclos de debate e intercâmbio técnico.

A participação nos Laboratórios de Inovação exige que todas as experiências sejam previamente aprovadas pelo Ministério da Saúde, sendo proibida a análise de casos experimentais locais.

A inovação em saúde, dentro do SUS, se restringe à criação de tecnologias e produtos farmacêuticos, sem envolvimento de processos organizacionais, práticas ou políticas públicas. 

As ações de educação permanente em saúde devem ser avaliadas apenas com base em indicadores financeiros, sem considerar o impacto sobre os profissionais ou na melhoria dos serviços prestados à população.