Ao conjunto da informação relativa a vários marcadores STRs em cromossomos diferentes dá-se o nome de haplótipo. 

O cromossomo Y apresenta uma variedade de polimorfismos do tipo STR, sendo uma importante fonte de informação em análises forenses, Y-STRs são marcadores genéticos de herança uniparental, ou seja, são passados dos pais aos filhos homens e estão situados no cromossomo Y humano.  

O conjunto de dados de loci analisados pode caracterizar o indivíduo, sendo os alelos diferentes daqueles encontrados nos irmãos, tios, primos, avô e demais antepassados masculinos. 

O DNA do cromossomo Y apresenta uma herança paterna, na forma haploide, ou seja, não apresenta uma cópia heteróloga, como acontece com os demais cromossomos.  

A falta de recombinação na maior parte do cromossomo Y faz com que ele se comporte como um fragmento único de DNA, que não se transmite intacto por via paterna à descendência masculina.