no Multiplex-PCR, a amplificação do segmento genômico é feita em duas etapas.

no Nested-PCR mais de um fragmento genômico é amplificado em uma única reação.

o Multiplex-PCR amplifica fragmentos específicos de RNA e DNA com uso de iniciadores.

no Nested PCR, a reamplificação do fragmento genômico aumenta a sensibilidade e especificidade da técnica.

o produto de amplificação obtido através de PCR em tempo real é visualizado em gel de poliacrilamida para maior precisão na detecção dos fragmentos genômicos amplificados.