O uso terapêutico de fator estimulador de neutrófilos (como filgrastim) no contexto da neutropenia febril reduz tempo de neutropenia, duração da febre e tempo de internação hospitalar.

Pacientes com neutropenia febril de alto risco, devem ser internados para tratamento antimicrobiano endovenoso. O regime de tratamento de primeira linha inclui monoterapia com qualquer uma das seguintes opções: ceftriaxone, cefepime, piperacilina-tazobactam, imipenem ou meropenem.

Casos selecionados de pacientes com neutropenia febril de baixo risco, podem ser tratados em regime ambulatorial. O regime antimicrobiano de primeira linha nesse cenário inclui uma combinação de uma fluoroquinolona (ciprofloxacino ou levafloxacino) + amoxicilina com clavulanato. Nos casos em que o paciente tenha histórico de alergia à penicilina, pode-se utilizar a clindamicina no lugar da amoxicilina com clavulanato.

São indicações de adição de cobertura antimicrobiana com vancomicina: presença de instabilidade hemodinâmica, suspeita de infecção de cateter e infecção de pele ou de tecidos moles.