A espectrometria de massas de alta resolução fornece a massa acurada dos íons detectados. Para contribuir com a identificação das substâncias analisadas por essa técnica, é necessário interpretar corretamente o espectro de massas. O processo de identificação não é trivial e nem automatizado, e inicia-se por determinar a fórmula molecular considerando uma série de informações.

As informações mais importantes nesse passo devem ser, com exceção de: