O diagnóstico de gastrite atrófica e metaplasia intestinal exige confirmação por biópsias sistemáticas, pois a correlação entre o aspecto endoscópico e a histologia é imperfeita na maioria dos casos.

A gastrite crônica superficial associada ao Helicobacter pylori localiza-se predominantemente no fundo gástrico e preserva a secreção ácida normal devido à ausência de resposta inflamatória no antro.

A gastrite aguda erosiva por uso de anti-inflamatórios não esteroidais manifesta-se endoscopicamente na maioria das vezes, por hipertrofia exuberante das pregas gástricas e ausência total de erosões ou petéquias na mucosa.

O tratamento da gastrite crônica com inibidores da bomba de prótons promove a reversão da atrofia gástrica e da metaplasia intestinal para mucosa normal em um curto período de tratamento. 

O sistema Operative Link for Gastritis Assessment utiliza a presença de Helicobacter pylori no muco para graduar o risco de desenvolvimento de linfoma gástrico de células B, considerando, ainda, aspectos histológicos e distribuição anatômica.