Na meningite criptocócica, a presença de pressão de abertura baixa no líquor e de alta celularidade são as características principais associadas a pior prognóstico.

No diagnóstico de aspergilose invasiva, raramente as hemoculturas são positivas, a cultura de escarro tem valor limitado, devido ao fato de que pode ser encontrado em 15% de pessoas normais e ao alto número de resultados negativos em aspergilose invasiva confirmada. A biópsia pulmonar oferece subsídios para o diagnóstico em até 90% dos casos.

Na murcomicose, a forma rinocerebral é a forma de apresentação mais comum, particularmente grave, com evolução fulminante na maioria dos casos. A forma pulmonar é a segunda em frequência da localização da infecção. A terapêutica precoce com anfotericina B, associada com a ressecção cirúrgica, é o tratamento de escolha.

A histoplasmose pode apresentar-se como uma lesão primária pulmonar, mimetizando tuberculose, podendo se disseminar. O diagnóstico pode ser feito através de isolamento a partir de lesões da pele, crescimento nas culturas, exames da medula óssea e/ou secreções respiratórias.

A candidemia em pacientes imunossuprimidos sem neutropenia tem alta taxa de mortalidade, contrariando o conceito de candidemia transitória ou benigna. Assim, todos os pacientes com candidemia, independentemente de sua fonte ou duração, devem receber tratamento antifúngico.