As complicações da hanseníase, muitas vezes, confundem-se com a evolução do próprio quadro clínico da doença. Muitas delas dependem da resposta imune dos indivíduos acometidos, outras estão relacionadas à presença do M. leprae nos tecidos, e algumas decorrem das lesões neurais características da hanseníase.

Decorrem da presença do bacilo na pele e em outros tecidos, principalmente em quantidades maciças, como é o caso dos pacientes palcibacilares (PB).

A rinite hansênica é causada pela intensa infiltração da mucosa do trato respiratório inferior.

A ulceração da mucosa septal leva à exposição da cartilagem, seguida de necrose e perfuração, ou mesmo perda parcial desse suporte da pirâmide oral. Se houver comprometimento dos ossos próprios nasais, o colapso nasal é completo, com o surgimento do característico nariz desabado ou “em sela”. 

Na área ocular, a triquíase decorre de processo infirmativo do próprio bulbo piloso ou por distrofia dos tecidos que apoiam os folículos, com posicionamento anômalo dos cílios, podendo atingir córnea e conjuntiva.