A assistência farmacêutica em âmbito hospitalar é quase que exclusivamente exercida por instituições públicas estatais, ou seja, vinculadas às secretarias de saúde estaduais e municipais.

Na assistência farmacêutica em âmbito ambulatorial, os serviços farmacêuticos são executados, em sua maioria, pela esfera municipal.

Os hospitais da esfera privada apresentam, geralmente, autonomia na administração de todas as etapas do ciclo da assistência farmacêutica, sem vínculo com outros serviços do Sistema Único de Saúde.

Os hospitais da esfera pública estatal, administrados diretamente pelo gestor estadual ou municipal no tocante à assistência farmacêutica, realizam a programação e a aquisição de medicamentos sob supervisão e vinculação a normas da secretaria de saúde.