A(s) lente(s) objetiva(s) que atua(m) na ampliação da imagem devem ser limpas periodicamente com solventes orgânicos, tais como xilol, toluol e acetona, entre outros, já que estes reagentes infiltram-se entre as lentes.

A platina, onde a amostra é colocada para visualização, está localizada diretamente sob a lente objetiva. 

Braço ou coluna é o suporte que sustenta os tubos, objetiva, e todo o conjunto. É o espaço destinado para o deslocamento do estereomicroscópio. 

Nas lentes oculares, a limpeza deve ser realizada com somente álcool absoluto (98 ou 99,5%) a fim de prevenir a entrada de água na estrutura de suporte das lentes evitando, assim, o embaçamento ou a proliferação de fungos.