O processamento histológico de rotina consiste em uma série de etapas com o objetivo de preparar determinado tecido a fim de ser analisado macroscopicamente. 

Imediatamente após a remoção de amostra de tecido a ser analisada microscopicamente, as peças devem ser mantidas em geladeira até o momento da fixação do tecido. 

Uma boa fixação depende da velocidade do fixador em penetrar no tecido a ser analisado, sendo que quanto mais rápida for a entrada do fixador no tecido, melhor será a qualidade do material fixado. 

As etapas de desidratação, diafanização e infiltração de parafina envolvem a difusão de reagentes que possibilite a saída de líquido dos tecidos – pois mesmo depois da fixação, os tecidos ainda retêm cerca de 85% de água – e a entrada de outros que sejam afins com a parafina que será impregnada adiante. 

Durante a inclusão do material, a posição do tecido no bloco não é importante, pois é possível alterar, posteriormente durante a microtomia, a incidência e o plano de corte do tecido.