A programação de medicamentos é um serviço logístico que prevê somente os tipos de medicamentos incluídos na lista padronizada. Essa programação pode ser obtida por meio da avaliação do histórico de consumo e da demanda. 

Um método simples para determinar a quantidade de medicamentos a ser adquirida é realizar a projeção da demanda, ou seja, atualizar o consumo do ano anterior, considerando somente o crescimento vegetativo da população.

No processo de aquisição de medicamentos, o critério utilizado para determinar a quantidade de medicamentos será apenas: quanto maior for a quantidade comprada, menores serão os custos envolvidos com a aquisição do produto.

O estoque real ou atual representa a quantidade (saldo) de medicamento ou material registrado no sistema informatizado de cada setor do hospital.

A gestão do controle de estoque é comumente realizada pelo método da Curva ABC, sendo que o grupo de medicamentos classificado como C representa a menor quantidade de itens com o maior custo financeiro e que devem ser gerenciados com atenção especial.