Os órgãos de controle externo têm obrigação de realizar auditorias solicitadas pelo sistema de controle interno.

Diferente do auditor interno, os auditores externos não possuem responsabilidade de implementar e de manter controles internos.

No âmbito municipal, o controle externo será exercido pelo Tribunal de Contas da União, com o auxílio da Câmara de Vereadores, Poder Legislativo local.

Por possuírem finalidades e competências distintas, os órgãos de controle e de auditoria interna e externa são impedidos de atuarem em cooperação.

Nos Municípios, onde não há Tribunais de Contas específicos para auxílio às Câmaras de Vereadores, os Tribunais de Contas Estaduais são os que dão tal auxílio, acumulando o controle externo no âmbito dos órgãos do Estado e dos Municípios do mesmo Estado.