Células apresentadoras de antígenos provenientes do doador apresentam antígenos HLA aos linfócitos T presentes no enxerto, o que caracteriza a via de apresentação direta de antígenos. 

 Células apresentadoras de antígenos provenientes do receptor apresentam antígenos HLA aos linfócitos T presentes nos linfonodos regionais o que caracteriza a via de apresentação indireta de antígenos.

O reconhecimento de antígenos HLA pelo receptor de célula T (sinal 1 de ativação) é uma condição necessária e suficiente para a ativação e proliferação do linfócito T e desencadeamento de rejeição, tanto em receptores sensibilizados, quanto em não sensibilizados.

A interação entre o CD28 dos linfócitos T e o CD80 ou CD86 das células apresentadoras de antígenos (sinal 2 de ativação) é uma condição relevante para o desencadeamento de rejeição, apenas em receptores não sensibilizados.