Independentemente do método de limpeza utilizado seja manual ou automatizado, todos utilizam detergente como agente de limpeza. Trata-se de produto destinado a limpeza de artigos e superfícies por meio da diminuição da tensão superficial, composto por grupo de substâncias sintéticas, orgânicas, líquidas ou pós solúveis em água que contém agentes umectantes e emulsificantes que suspendem a sujidade e evitam a formação de compostos insolúveis ou espuma no instrumento ou na superfície (BRASIL, 2012). Os detergentes usados no processamento de produtos para saúde têm que ser regularizados junto à ANVISA, e são classificados de acordo com o pH; sendo classificados como:

I. Detergentes alcalinos: são recomendados para limpeza automatizada, pois demandam maior temperatura para atingir níveis ótimos de ação (entre 60 e 70 °C). Auxiliam na remoção de manchas dos instrumentos, renovando seu brilho natural, característica que permite dispensar o uso de produtos restauradores.
II. Detergentes neutros sem adição de enzimas: são próprios para limpeza de produtos para saúde, tem pH entre 6,5 e 7,5, podem ser utilizados para limpeza de materiais (não críticos e superfícies) com pouca quantidade de matéria orgânica (almotolias, pias, bancadas, autoclave, equipamentos, etc.). Também é recomendado para instrumentos oftalmológicos
III. Detergentes neutros enzimáticos são amplamente recomendados para limpeza de artigos porque possuem enzimas catalisadoras que facilitam a quebra de proteínas, lipídeos e carboidratos dependendo de sua formulação, favorecendo a remoção de matéria orgânica e diminuição da carga microbiana. Deve-se utilizar vários tipos de agentes limpante para cada processamento. A mistura de produtos potencializa a eficiência da limpeza e diminui o risco ocupacional.
IV. Detergente ácidos: são próprios para limpeza com PH abaixo de 6,0. Recomendados para limpeza de espéculos e instrumentais ginecológicos.
V. Detergente enzimático: promovem a remoção da matéria orgânica em curto período de tempo através da ação de enzimas que decompõem o sangue e fluídos corporais aderidos aos artigos, facilitando sua remoção; facilitam a limpeza de locais de difícil acesso ou lúmen estreito. Todas as superfícies do material necessitam estar em contato com a solução de detergente (interna e externa), por isso é fundamental a abertura de pinças, desmontagem dos artigos complexos e preenchimento de lúmens para melhor remoção dos resíduos. Seu uso não substitui a fricção dos artigos durante o processo de limpeza.

Com base nas afirmações anteriores, podemos dizer que: