Cápsula endoscópica (CE), que é um exame seguro, não invasivo e portanto não apresenta contraindicações; no entanto, tem suas limitações como não permitir aquisição de biópsias ou instituir terapêutica como polipectomia e hemostasia. 

Endoscopia digestiva alta, que pode ser um exame diagnóstico eletivo/ambulatorial, mas pode também ser utilizado em casos de urgência (como hemorragias digestivas) e emergência (como baterias impactadas em esôfago).

Colonoscopia, que é um exame invasivo, de preparo delicado (risco de distúrbios hidroeletrolíticos), mas que, se bem indicado (como na colite fulminante e rastreamento de câncer colorretal), apresenta um benefício inquestionável.

Colangiopancreatografia retrógrada endoscópica (CPRE), que revolucionou a terapêutica de lesões pancreatobiliares, mas ainda continua sendo um método diagnóstico fundamental para patologias como coledocolitíase.