No modelo tradicional, a seleção de medicamentos é conduzida pela Comissão de Farmácia e Terapêutica (CFT), que fundamenta suas decisões em critérios científicos de eficácia, segurança e custo-efetividade, de forma independente das preferências dos prescritores.

No sistema de guia farmacoterapêutico, a inclusão de medicamentos ocorre predominantemente com base na experiência clínica dos profissionais da instituição, cabendo à revisão crítica da literatura apenas confirmar as decisões previamente adotadas.

No método de concursos de medicamentos, a Comissão de Farmácia e Terapêutica (CFT) participa do processo licitatório e é responsável pela seleção do fornecedor vencedor do certame, enquanto a definição dos medicamentos a serem adquiridos ocorre posteriormente.

No sistema de análise de decisão multiatributos, pode ser adotada a teoria da utilidade multiatributo, um método de análise sistemático e quantitativo que utiliza pesos para os atributos de avaliação e calcula a utilidade global de cada alternativa para apoiar a tomada de decisão.

No sistema de avaliação por objetivos, são definidos critérios para avaliação de cada fármaco ou classe terapêutica, sendo atribuído o mesmo número de pontos a todos os critérios para determinação da pontuação final dos medicamentos.