A microbiota dos solos é carente de carbono, ou seja, faltam compostos orgânicos energéticos para sua nutrição.

Mudanças na composição da rizosfera quando da ocorrência de um patógeno na planta indicam que a planta pode, neste momento, alterar a composição de seus exsudatos radiculares, selecionando grupos microbianos específicos que a auxiliem no combate ao patógeno. 

Rizobactérias promotoras do crescimento de plantas são definidas com alta afinidade de ocupação do ambiente rizosférico, e capazes de desempenhar atividades relacionadas à promoção do desenvolvimento das plantas.

A alta exsudação de moléculas quelantes de íons por rizobactérias na produção de sideróforos, que são compostos que disponibilizam íons de ferro para a nutrição de organismos oportunistas na rizosfera, resulta na inibição da atividade desses patógenos. 

Microbianos específicos na rizosfera das plantas produzem moléculas análogas a fitormônios, com destaque para as similares ao ácido indolacético, fazem com que um rápido e mais intenso crescimento vegetal dê origem a uma maior resistência da planta a estresses bióticos como abióticos