Os trofozoítos são encontrados na maioria dos indivíduos com giardíase, enquanto que achado de cistos é menos frequente.  

A observação do aspecto e da consistência das fezes fornece informações sobre a forma evolutiva a ser pesquisada, uma vez que em fezes formadas (sólidas) e diarreicas, predominam cistos e trofozoítos, respectivamente. 

Em fezes formadas, os cistos podem ser destacados através de métodos de escolha que são o MIF e o método de Faust. 

Em fezes diarreicas encontram-se trofozoítos que perecem rapidamente. Por isso, recomenda- -se colher o material no laboratório e examinálo imediatamente. 

Recomenda-se, o exame de três amostras com intervalo de sete dias entre cada uma, conduta que aumenta a positividade da pesquisa de Giardia lamblia nas fezes.