O diagnóstico é feito por meio da amplificação de sequências genômicas por RT-PCR nos primeiros 7 a 8 dias de sintomas, e sorologia (IgM e IgG) a partir do 5º dia dos sintomas. Usualmente, IgM para CHIKV começa a ser positiva a partir do 5º dia, atinge um pico entre 2 e 3 semanas e pode permanecer por até: