essa metodologia permite analisar propriedades imunogênicas e moleculares de um dado antígeno.

essa metodologia compreende a transferência de amostras separadas por meio de eletroforese em gel de poliacrilamida para membranas que são então incubadas com anticorpos mono ou policlonais específicos para o antígeno que se deseja detectar.

a reação de detecção do antígeno utiliza substratos que, ao serem clivados, geram precipitados que se depositam em uma membrana contendo a amostra a ser analisada.

a utilização de um determinado anticorpo para detecção de um dado antígeno em imunoensaios do tipo ELISA assegura que este apresenta especificidade compatível com a sua utilização também em ensaios de western blotting.

as amostras complexas, como lisados celulares, podem ser preparadas com diferentes tampões, contendo ou não agentes redutores que rompem a ligação covalente entre duas cisteínas presentes em um dado antígeno.