Para a seleção de medicamentos, deve ser constituída uma Comissão de Farmácia e Terapêutica. Essa comissão deve ser constituída exclusivamente por profissionais farmacêuticos e deve ser legitimada por meio de uma portaria.    

Na seleção de medicamentos, a comissão de farmácia e terapêutica deve padronizar preferencialmente as associações de fármacos, uma vez que, por terem efeito sinérgico, essas associações apresentam maior resolutividade dos problemas de saúde. 

Para a elaboração do formulário terapêutico, devem ser utilizadas referências parciais, como por exemplo, periódicos internacionais indexados, livros tradicionais, Micromedex, entre outros. Materiais de consulta elaborados por laboratórios farmacêuticos também podem ser utilizados como fonte de informação confiável sobre medicamentos.   

Um dos trabalhos pertinentes à Comissão de Farmácia e Terapêutica é a elaboração de estratégias que incentivem a aceitação e adesão à Relação Municipal de Medicamentos Essenciais por parte dos prescritores.