São consideradas infecções hospitalares as que ocorrem em recém-nascidos cuja transmissão ocorreu pela via transplacentária (rubéola, toxoplasmose e sífilis). 

Infecção de sítio cirúrgico em procedimento com colocação de prótese é considerada infecção hospitalar até 1 mês após a cirurgia. 

Quando, na mesma topografia em que foi diagnosticada infecção comunitária, for isolado um germe diferente, seguido do agravamento das condições clínicas do paciente, o caso deverá ser considerado como infecção hospitalar.

A pneumonia associada à ventilação mecânica precoce é aquela que ocorre em paciente com menos de 7 dias de internação hospitalar independente do tempo de ventilação mecânica.