O teste respiratório com ureia marcada com carbono (C13) é o gold standard dentre os métodos não invasivos. Porém esse método apresenta acessibilidade limitada no Brasil

A histologia é o método invasivo gold standard, sendo recomendado a obtenção de 2 amostras do antro e 2 amostras do corpo gástrico, de forma a fornecer uma maior sensibilidade de detecção, assim como uma análise morfológica da mucosa gástrica 

Para a pesquisa de Helicobacter pylori com o teste rápido da urease, é recomendado a coleta de uma biópsia do antro e de uma biópsia do corpo gástrico, sendo este teste recomendado tanto para diagnóstico inicial quanto para controle de erradicação pós-tratamento 

Antes da realização de exames diagnósticos para detecção de Helicobacter pylori, devem ser descontinuados alguns medicamentos que podem prejudicar a sensibilidade do exame, como os inibidores de bomba de prótons (2 semanas antes) e antibióticos (4 semanas antes) 

O controle de tratamento do Helicobacter pylori deve ser realizado pelo menos 4 semanas após o término do tratamento com antibióticos