A fase de empacotamento deve ser realizada após higienização das mãos, sem obrigatoriedade de equipamento de proteção individual (EPI), organização dos instrumentais apenas por peso para evitar irregularidades e seleção da embalagem de acordo com o processo de desinfecção.

Uma central de esterilização deve ser dividida ao menos em três áreas distintas e separadas por barreiras físicas: a área suja (expurgo), a área limpa (preparo do material e esterilização) e a área estéril (armazenamento e distribuição dos materiais estéreis). 

 A central de esterilização é classificada como área semicrítica, pois executa processos envolvendo artigos não-críticos utilizados em procedimentos invasivos (cirúrgicos), tendo assim um risco moderado de transmissão de infecções.

São atribuições do técnico de central de esterilização: receber e conferir materiais; atualizar constantemente o manual de normas de biossegurança e garantir sua aplicação; coordenar e atuar na administração e em intercorrências do setor; solicitar materiais e equipamentos, realizar controle dos indicadores biológicos.

Recomenda-se que na central de esterilização seja realizada esterilização de artigos de laboratórios anexos ao serviço, limpeza mensal do espaço e estocagem de materiais das clínicas e do setor de esterilização.