A chegada dos trilhos da Estrada de Ferro Araraquara, em 1909, ocorreu simultaneamente à elevação da localidade à categoria de distrito de paz, impulsionando o primeiro surto de progresso econômico.

Embora o município tenha enfrentado uma pesada cota de desmembramento territorial por volta de 1925, o impacto econômico foi mitigado pelo fato de Pindorama ter surgido, quatro anos mais tarde, como um dos maiores centros produtores de café do estado.

O núcleo original do povoamento foi estabelecido no final do século XIX por desbravadores como Ferdinando Mota e os irmãos Lainetti, que iniciaram as primeiras lavouras em área de mata virgem.

O topônimo "Pindorama" possui origem na língua indígena e faz referência direta ao acidente geográfico central do município, o ribeirão São Domingos, que corta a localidade entre duas encostas.