Os hospitais devem contar com uma Comissão de Controle de Infecção Hospitalar (CCIH) para fazer o diagnóstico de casos de infecção hospitalar, padronizar as técnicas de assepsia, promover o treinamento de funcionários, ajudar no planejamento do espaço físico do hospital, controlar a utilização de antibióticos no trato das infecções (para impedir o uso abusivo), entre outras atribuições.

Recém-nascidos, idosos, diabéticos, pessoas com câncer e transplantados apresentam maiores riscos, pois estes possuem alterações em seu sistema de defesa contra os microrganismos.

Sua prevenção depende muito mais dos pacientes do que da instituição hospitalar e de seus trabalhadores.

A infecção hospitalar pode ser causada por falta de assepsia no meio ambiente, no paciente e da equipe que o atende.

Em procedimentos cirúrgicos sempre existem mais riscos de contrair esse tipo de infecção do que em uma internação sem esses procedimentos.