Diarreia decorre da perda de superfície absorvedora, supercrescimento bacteriano, hipersecreção gástrica e excesso de sais biliares.

Nos pacientes com diarreia e cólon em continuidade, a dieta ofertada deve ser pobre em glicose e oxalato, rica em lipídio e reduzida osmolaridade.

Pacientes com menos de 100 cm de intestino remanescente podem desenvolver diarreia por excesso de sais biliares no cólon e podem responder bem à colestiramina.

Adaptação intestinal em adultos ocorre em até 1 ano. Assim, pacientes que ultrapassam este período dependentes de nutrição parenteral provavelmente nunca conseguirão se tornar independentes desta terapia.

A incidência de cálculo biliar é aumentada, mas litíase renal é raro.