Embora não se trate de uma ameaça à saúde pública, a ocorrência da EEB tornou-se a base para extensos programas nacionais de vigilância e prevenção em diversos países do mundo.

Como medida de prevenção da EEB, destaca-se o cuidado na criação dos ruminantes, como não alimentá-los com certos produtos de origem animal, inclusive com cama de aviário, resíduos da exploração de suínos e farinhas produzidas a partir de resíduos animais.

O leite é considerado um produto de alto risco para transmissão da EEB para humanos, devendo ser descartado quando for oriundo de animais com suspeita da doença.

Em decorrência de sua alta mutabilidade, o agente etiológico originalmente causador da EEB sofreu uma mutação, passando a provocar a chamada “forma atípica” da doença. 

Mesmo jamais tendo sido confirmada a ocorrência da forma atípica da EEB no Brasil, o País mantém um robusto sistema de vigilância com o intuito de demonstrar sua ausência.