O empacotamento dos instrumentos odontológicos deve garantir e manter o conteúdo estéril durante o armazenamento e transporte. Deve, também, permitir o manuseio adequado, facilitando a abertura e permitindo a utilização segura.

A limpeza e desinfecção das superfícies operatórias fixas e partes expostas do equipo reduz, significativamente, a contaminação cruzada ambiental.

Desinfecção é a completa eliminação ou destruição de todas as formas de vida microbiana viáveis.

Para facilitar a remoção de sujidades e resíduos orgânicos usa-se detergente enzimático. O instrumental deve permanecer totalmente imerso, por 15 minutos, quando se utiliza a limpeza manual. Em caso de utilização de limpeza mecânica, a fórmula de preparo da solução e o tempo de imersão devem seguir as orientações do fabricante.