Dentre as principais características morfológicas dos micro-organismos, podemos citar o tamanho, a forma e a estrutura celular, sendo que os micro-organismos podem variar, em tamanho, de alguns micrômetros a apenas alguns nanômetros, como é o caso dos vírus. A estrutura celular pode variar dependendo do tipo de microrganismo mas, em geral, eles apresentam uma membrana plasmática, citoplasma e material genético, que pode estar presente em uma região específica da célula. Para um tipo de microorganismo essa estrutura celular está dispersa em toda a célula. Trata-se do seguinte microorganismo: