Os principais sinais e sintomas neurológicos do botulismo alimentar são boca seca, diplopia, disfagia, disartria, ptose palpebral e visão turva. O quadro neurológico tem como característica a paralisia flácida aguda motora descendente, o que diferencia o botulismo da síndrome de Guillain-Barré, na qual ocorre paralisia ascendente.