O Sistema Nacional de Auditoria – SNA é o conjunto de órgãos e unidades instituído de forma centralizada pela Lei nº 8.689/93 e regulamentada pelo Decreto nº 1.651/95.

As atividades de auditoria são definidas pelo Sistema Nacional de Auditoria, que classifica as ações de acordo com as atividades a serem executadas, sem considerar os diferentes níveis de complexidade (primária, secundária e terciária).

O processo de auditoria no SUS é composto da fase organizacional, analítica, operativa ou in loco e da fase de relatório final.

Uma das finalidades da auditoria no ANALISA – SUS é produzir informações para subsidiar a avaliação das ações que contribuam para o aperfeiçoamento do SUS.

Auditoria de serviços de saúde, auditoria de ações em saúde e auditoria sobre a aplicação de recursos financeiros são consideradas como tipos de auditoria nos sistemas de saúde.