Uma forma de inovação que tem sido objeto de destaque dentro do agronegócio diz respeito à chamada logística colaborativa, que é pautada na busca pelo estabelecimento de parcerias e relacionamentos diferenciados entre empresas com o objetivo de conseguirem benefícios mútuos. 

As operações logísticas envolvem, além das entregas de produtos aos clientes, a movimentação de materiais, componentes e produtos para reabastecimento de estoques que se encontram em armazéns, depósitos, distribuidores, fábricas e nos próprios pontos de varejo.

Apoiar a comercialização, dentro da visão da logística aplicada ao agronegócio não significa fomentar que os armazéns e depósitos necessários sejam aprimorados e desenvolvidos, entre muitas outras relações possíveis que fogem à lógica relativa aos sistemas de transporte, por exemplo.

O transporte logístico colaborativo é realizado quando existe a busca por parcerias para o compartilhamento de cargas que serão transportadas e distribuídas de comum interesse entre algumas empresas, o que objetiva a diminuição dos custos de transporte para ambas.