O teste de amplificação de ácidos nucleicos, (TAAN), a partir de amostras coletadas por swab da conjuntiva tarsal inferior é usado no diagnóstico da conjuntivite de inclusão, dada a sua alta sensibilidade e especificidade. Outros exames correspondem aos anticorpos fluorescentes diretos, (DFA), ou testes de imunoensaio enzimático, (EIA). A cultura e a coloração de Giemsa são usadas, mas têm sensibilidade consideravelmente menor.

O Tracoma é uma doença infecciosa crônica causada pelos sorotipos A, B, Ba e C da Chlamydia trachomatis e é a principal causa infecciosa de cegueira evitável no mundo. A conjuntivite é a principal manifestação clínica do tracoma ativo, uma ceratoconjuntivite crônica causada por infecções recorrentes por C. trachomatis que raramente acomete os folículos tarsais. Essa doença ocorre, em sua maioria, em países em desenvolvimento.

A conjuntivite de inclusão é uma infecção ocular crônica causada pela bactéria Chlamydia trachomatis, (sorotipos D-K), frequentemente associada a infecções sexualmente transmissíveis, (ISTs), contudo a infecção urogenital concomitante é rara.

A conjuntivite bacteriana hiperaguda, (gonocócica), é caracterizada por uma secreção purulenta abundante, que pode se manifestar a partir de 12-48 horas após a inoculação em adultos. Os sintomas são rapidamente progressivos e incluem vermelhidão intensa, irritação e sensibilidade à palpação. A perfuração corneana é frequente, apesar do tratamento precoce e adequado.