Em adultos com conjuntivite bacteriana, Staphylococcus aureus é a bactéria mais comumente identificada, (26%), seguida por outras espécies de Staphylococcus. Espécies de coliformes, bem como H. influenzae, M. catarrhalis e S. pneumoniae também são identificadas). A prevalência de Pseudomonas também aumenta em níveis de atenção primária e terciária.

Em adultos, a flora conjuntival normal inclui estafilococos coagulase-negativos, (predominantemente S. epidermidis), S. aureus, Propionibacterium, Corynebacterium, e Haemophilus influenzae.

Espécies de Neisseria, particularmente N. gonorrhoeae, podem causar conjuntivite bacteriana hiperaguda, grave e com risco de perda da visão em adulto e requer encaminhamento oftalmológico imediato. Em adultos, o organismo geralmente é transmitido dos genitais para as mãos e, em seguida, para os olhos.

O uso de antibióticos, particularmente Fluoroquinolonas, não apresenta risco de resistência a antibióticos entre os patógenos oculares visto que os efeitos sistêmicos são de baixa relevância clínica.