Uma única amostra de fezes com ausência de formas evolutivas de Entamoeba histolytica é critério definitivo para descartar amebíase intestinal.

O diagnóstico laboratorial de doenças causadas por Cryptosporidium sp., Entamoeba histolytica e Giardia duodenalis só pode ser feito por exame direto das fezes, pois não se dispõe de testes antígenos fecais sensíveis e específicos.

A Giardia lamblia é um patógeno intestinal transmitido através de água e alimentos contaminados com cistos. Os cistos apresentam 4 núcleos e se alternam para forma de trofozoítos que se multiplicam no intestino delgado e aderem à mucosa através de um disco aderente. 

A ascaridíase é uma helmintose intestinal causada por Ascaris lumbricoides, e seu diagnóstico pode ser obtido por exame parasitológico de fezes, em que se visualizam ovos característicos com espérculos nas extremidades, dando o formato de barril. 

A ancilostomose é uma parasitose intestinal causada pelo Ancylostoma duodenale e é morfologicamente confundido com o helminto não patogênico Necator americanus.