O paciente, quando submetido a procedimentos invasivos e ao uso de antimicrobianos de amplo espectro, vai alterando sua microbiota (colonização da orofaringe, da pele e do trato digestivo), permanecendo colonizado por microrganismos resistentes aos antimicrobianos administrados.

Quando se identifica um surto, devem ser instituídas medidas de controle imediatamente. Entre elas, a orientação dos profissionais, higienização das mãos, isolamento dos casos e coletas de culturas de superfícies e equipamentos, dado que o ambiente é o principal responsável pelos surtos.

Os investigadores de um surto devem estar atentos para variáveis que podem influir na taxa de infecção em estudo e levar à interpretação errônea de que se trata de um surto. O mais importante fator que conduz a isso é um erro na identificação do agente envolvido.

Por definição, todos os surtos hospitalares são preveníveis, o que ressalta a importância da investigação dos surtos o mais precocemente possível.

É impossível o controle de um surto sem o fechamento do hospital.