Lagoas de decantação - situadas no final do sistema de tratamento, têm como principais objetivos, a remoção de organismos patogênicos principalmente em sistemas de tratamento de esgotos sanitários ou reunidos com águas residuárias industriais, e a remoção de nutrientes como fósforo e nitrogênio.

Lagoas de maturação - situadas no final do sistema de tratamento, têm como principal objetivo reduzir a concentração de sólidos em suspensão do efluente final.

Lagoas facultativas - situadas logo após as lagoas anaeróbias, podendo também ser situadas após o tratamento preliminar (sem lagoa anaeróbia) as lagoas facultativas são concebidas como tratamento secundário.

Lagoas anaeróbias - situadas geralmente após o tratamento preliminar, tem sido utilizadas no tratamento de águas residuárias com cargas orgânicas elevadas. São adotadas, geralmente, como a primeira de uma série de lagoas, efetuando o tratamento secundário.