A matéria orgânica do solo (MOS) possui diferentes funções, em que a importância de cada uma varia com o tipo de solo, o clima e o uso da terra. Em geral, a função mais importante da matéria orgânica é a reserva de nitrogênio e outros nutrientes necessários para o crescimento das plantas. Dependendo dos objetivos estabelecidos pelo agricultor, são exigidas diferentes práticas de manejo para alcançá-los. Os possíveis objetivos são: manutenção do teor de MOS, visando melhorar as propriedades físicas e hidrológicas do solo, obtenção de máxima absorção de nutrientes oriundos de adubos orgânicos ou da MOS originalmente existente, diminuição da evaporação ou da temperatura do solo através do uso de cobertura morta (“mulch”) ou diminuição da erosão do solo. Uma vez identificado um objetivo, as atividades microbianas promotoras podem ser identificadas como um dos fatores a serem considerados no planejamento apropriado de práticas de manejo. Quais são os principais fatores que influenciam a atividade microbiana na matéria orgânica adicionada ao solo: