dentre as doenças que não apresentam mecanismos de resistência genética, destacam-se a ferrugem alaranjada (Puccinia kuehnii) e o carvão (Ustiliago scitaminea)

visando o aumento do rendimento e a redução das perdas na colheita mecanizada, uma característica importante no melhoramento genético da cana-de-açúcar é a obtenção de genótipos que apresentem colmos uniformes, com diâmetros finos e que se quebrem com facilidade.

a resistência varietal é um caráter importante para as variedades de cana-de-açúcar, pois influencia na diminuição ou na eliminação do uso de defensivos na lavoura, reduzindo custos de produção e impactos ambientais.

busca-se com o melhoramento genético uma variedade de cana-de-açúcar com baixa capacidade de perfilhamento e brotação pós-corte, para que se tenha incremento da produtividade na colheita mecanizada.

as brocas (Diatrea saccharalis e Diatrea flavipennella) que atacam a cana-de-açúcar têm sido combatidas através de controle biológico e químico, pois ainda não se tem nenhuma variedade de cana-de-ácuçar com resistência genética a elas.