A quarentena é o espaço físico para isolamento inicial dos animais e deverá ter condições ambientais apropriadas de alojamento, onde estes possam permanecer antes de serem transferidos para as salas de criação e manutenção.

A área de higienização é a área destinada à lavagem e desinfecção ou esterilização de materiais, insumos, equipamentos e suprimentos.

É recomendado que o vestuário utilizado nas rotinas e áreas de um biotério seja lavado pelo próprio funcionário em sua residência, a fim de reduzir a contaminação cruzada, caso fosse lavado em uma lavanderia própria do biotério.

O ambiente para eutanásia dos animais deverá estar separado e localizado em área que não cause distúrbio aos animais alojados no biotério.

As salas de animais devem ser separadas por espécie.