O curso surgiu a partir da iniciativa de músicos da Faculdade de Educação Musical do Paraná em parceria com músicos de outras universidades, para atender a população paranaense e criar um intercâmbio entre as instituições. 

A pós-graduação em Musicoterapia era destinada a pessoas formadas em diferentes áreas do conhecimento; sendo que a formação era de quatro anos e no período noturno.  

Em 1968, a professora e musicista Clotilde Espindola Leinig foi em busca de aperfeiçoamento nas áreas de Musicoterapia e Regência Coral nos Estados Unidos. Ao retornar ao Brasil, promoveu uma série de ações para abertura do curso de Musicoterapia na cidade de Curitiba o que aconteceu em 1971.

No ano 2000, o Bacharelado em Musicoterapia, foi fundado na Faculdade de Artes do Paraná, para atender a demanda de músicos e médicos que tinham interesse na formação.

Em 1971 foi criado o curso de Bacharelado em Musicoterapia na Faculdade de Artes do Paraná.