O vírus da febre aftosa é um DNA-vírus pertencente à família Picornaviridae, o qual é considerado de baixo contágio entre os animais de casco fendido. 

Trata-se de uma doença de notificação obrigatória, de acordo com o Código Sanitário para Animais Terrestres (OIE), raramente fatal em animais adultos, podendo causar mortalidade entre os animais jovens.

O vírus da febre aftosa não é sensível ao pH, sendo inativado em faixas superiores a 6.

O diagnóstico da febre aftosa se baseia na detecção de anticorpos contra proteínas não estruturais do vírus pelo ELISA 3ABC/EITB, detecção de anticorpos pelo ensaio de neutralização viral, detecção do DNA viral por RT-PCR em tempo real, isolamento e identificação viral.