A migrânea infantil manifesta-se exclusivamente por dor occipital contínua, sem sintomas autonômicos, devendo-se sempre solicitar TC de crânio para excluir tumor de fossa posterior. 

Em crianças, os ataques de migrânea podem durar de 2 a 72 horas (duração menor que no adulto), a dor é frequentemente bilateral (frontotemporal) em vez de unilateral, e deve estar associada a náusea/vômitos e/ou fotofobia e fonofobia, piorando com atividade física habitual.

O diagnóstico exige obrigatoriamente a presença de aura visual típica antes da dor; se não houver aura, classifica-se como cefaleia tensional.

 Para o diagnóstico, a cefaleia deve ser unilateral e pulsátil em 100% dos casos, assim como nos adultos, não sendo aceita a localização bilateral.