A CAPOC não possui condão disciplinar. Suas tratativas administrativas se limitam apenas a acompanhar eventuais correições e diligências realizadas por Órgãos de controle externo, tais como o Ministério Público.

Com o advento do Decreto 13.502/2012, o acompanhamento das atividades periciais e de identificação, visando ao cumprimento da legislação, passou a ser de exclusividade da Corregedoria-Geral da Polícia Civil.

É competência da CAPOC inspecionar os atos procedimentais da Coordenadoria-Geral de Perícias, em face das infrações disciplinares praticadas por seus servidores, conhecendo as requisições e as solicitações dos órgãos e das entidades de controle externo. 

Não é de competência da CAPOC proceder à instauração de sindicância administrativa disciplinar, de auto de investigação preliminar ou de outro procedimento apuratório relativo às infrações administrativas atribuídas a servidores da Coordenadoria-Geral de Perícias. Todos esses procedimentos são diretamente conduzidos pela Corregedoria-Geral da Polícia Civil do Estado.

A competência da CAPOC frente à Corregedoria-Geral da Polícia Civil não possui concorrência, sendo exclusiva da CAPOC a condução de procedimentos administrativos em desfavor a outros servidores estranhos à Coordenadoria-Geral de Perícias.