Cerca de 2/3 dos casos de rabdomiossarcoma ocorrem em crianças até 6 anos de idade e a presença de tumoração local é a manifestação mais encontrada da doença.

Geralmente estão associados a quadros de abdome agudo, pois podem obstruir a luz do trato gastrointestinal principalmente quando originários da musculatura lisa (não estriada) da porção gástrica distal ou duodenal. 

As manifestações clínicas mais frequente são vômitos, dispepsia, dificuldade alimentar, graus variados de obstrução gastrointestinal e emagrecimento. Até 40% das crianças apresentam doença metastática ao diagnóstico, sendo o fígado o local mais comum de metástase.

O rabdomiossarcoma, origina-se da musculatura lisa (não estriada), principalmente do trato gastrointestinal, que começa a se formar no embrião por volta da quarta semana após a fertilização. Nessa fase, tem início a formação dos rabdomioblastos; são essas células que podem se tornar malignas e originar o rabdomiossarcoma.