Um grande número de micro-organismos causa doenças em humanos. Infecção é a entrada e o desenvolvimento ou multiplicação de um agente infeccioso no hospedeiro. Infecção não equivale a doença, pois algumas infecções não produzem doença clínica.
As características específicas de cada agente são importantes para determinar a natureza da infecção, que é determinada por fatores tais como: