O módulo assistencial do HIS é responsável pelo registro das informações clínicas do paciente e pelo gerenciamento financeiro das contas hospitalares, incluindo faturamento e conciliação de pagamentos. 

O HIS permite integrar informações relacionadas ao atendimento do paciente, internação, faturamento, estoque e farmácia, favorecendo o fluxo de informações e a coordenação entre os diferentes setores da instituição. 

O módulo de suprimentos e estoque realiza o controle de entrada, saída e consumo de materiais e medicamentos, sendo também responsável pela definição e validação das prescrições medicamentosas registradas durante a internação. 

O módulo ADT (Admissão, Transferência e Alta) realiza o registro da admissão e da movimentação do paciente na instituição, enquanto o Prontuário Eletrônico do Paciente (PEP) é responsável pelo controle do censo hospitalar e pela sinalização da necessidade de higienização dos leitos vagos.